Народився 11 листопада 1997 року в м. Краматорськ Донецької області. Навчався в школі № 12. Займався греко-римською боротьбою, футболом, був голкіпером юнацької команди ФК «Авангард» (Краматорськ). Відзначений відділом молоді і спорту Краматорської міської ради за вагомий особистий внесок у реалізацію державної політики у галузі фізичної культури та спорту. Став одним із засновників міської команди КВК, яка захищала честь Краматорська в різних регіонах України. Разом з друзями опікувався малюками з дитячого будинку «Антошка».
З початком Революції Гідності та на фоні побиття студентів на Майдані Незалежності у Києві, Степан почав приділяти значну увагу політичним процесам, що відбувалися в країні. Був активним учасником Краматорського Євромайдану. Не зважаючи на свій 16-річний вік, сам організував марш підтримки в лютому 2014 року. В подальшому Степан регулярно бере участь в проукраїнських мітингах.
Після окупації Краматорська навесні 2014 року Степан разом з друзями самоорганізувалися і вели підпільну боротьбу: розповсюджували листівки, нагадуючи, що Краматорськ – це Україна; збирали інформацію про ворога; забезпечували українських військових, що стояли в передмісті та на аеродромі, водою, засобами гігієни тощо. Серед іншого, Степан особисто зняв з центральної площі міста триколор т.зв. ДНР (наразі цей трофей знаходиться в музеї Степана Бандери в м. Косів Івано-Франківської області).
В кінці червня 2014 року Степан поїхав до Києва, щоб доєднатися до складу добровольчого батальйону, але через свій вік зміг потрапити лише до Сотні Лева. Через місяць він повертався на Донеччину, де був затриманий т. зв. контррозвідкою МГБ ДНР та звинувачений в шпіонажі на користь України.
29 липня 2014 року, після тижня катувань і знущань, за відмову стати зрадником і йти вбивати українців, за свою проукраїнську позицію та активну протестну діяльність, без будь-якого навіть формального слідства та суду, у віці 16 років Степан ЧУБЕНКО був розстріляний бандформуванням «Керч» в с-щі Горбачово-Михайлівка (передмістя Донецька).
Зухвалість цього воєнного злочину вразила навіть самих росіян, які у вересні 2014 року самостійно розформували вказане бандформування. Тим самим, своїм прикладом Степан показав, що захищати Україну можна навіть без зброї – ціною власного життя 16-річний юнак знищив бандформування «Керч».
Нагороди:
Орден «Народний Герой України»
Орден «За мужність III ступеню»
Нагрудний знак «Кров за Україну»
Медаль «За жертовність і любов до України»
Медаль «Степан Чубенко. Гідність і спорт»
Указом президента №738/2025 від 1 жовтня 2025 р. присвоєно звання Герой України з удостоєнням ордена «Золота Зірка».
В Краматорську ім’я Степана ЧУБЕНКА було присвоєно його рідній школі № 12.
Його ім’ям названа одна з вулиць міста, відкрито пам’ятник, в школі і біля входу на місцевий стадіон «Авангард» встановлені пам’ятні дошки.